PEAKS Studio 8.5隆重推出
2017-08-11

亲爱的用户,PEAKS Studio 8.5已在2017年8月9日隆重推出,如您在2016年8月9日后购买使用了PEAKS Studio 8.0,可直接进行更新。

您可以访问以下地址观看PEAKS STUDIO 8.5的更新专题视频:http://www.bilibili.com/video/av13291952/

PEAKS STUDIO 8.5新功能介绍新功能介绍

1. SILAC定量功能增强

基于新的 SILAC pair feature detection 和 alignment 算法*,我们提升了SILAC定量的精确度和灵敏度

加入比值为中心的定量方法 (如 super-SILAC)

多组差异比较 (如时间序列定量)

增加更多统计方法:

Paired t-test 用于两样本间比较分析

Welch’s ANOVA 用于多组比较分析

                                              图1:PEAKS SILAC 定量结果与MaxQuant相当


2. Label Free定量功能改进

  • 自动选择丰度最强的前三名unique peptides进行LFQ

  • 增加LFQ定量精度:

排除发生可变修饰的肽段

排除冗余肽段

  • 肽段列表中也提供了基于肽段水平的定量结果

  • 增加样本聚类和相关性视图

*  若鉴定结果里面存在一个没有修饰的肽段A,同时也存在一个有修饰的肽段A,这两个肽段不用于定量。如果只存在一个没有修饰的A或者是一个有修饰的A,这种情况下A会被拿来做定量分析。

                                                            图2:非标定量功能改进


3. PTM 分析功能改进

增加如下PTM分析功能:

基于鉴定结果的PTM定量分析(图3): 多样本PTM比较;修饰和未修饰的MS2谱图比较

基于定量分析节骨偶的PTM定量分析(图4): 基于A-score或峰强度过滤的可信PTM定量结果展示;基于蛋白水平归一化;PTM位点聚类;修饰肽及特征峰细节展示

                                   图3:基于鉴定结果的PTM定量分析

                                 图4:基于定量分析结果的PTM定量分析


4. 分析结果比较界面改进

PEAKS Studio 8.5在鉴定结果中自动提供半定量分析数据(或者说丰度信息)。丰度信息包括spectral counting和MS1峰面积。


5. 新增对EThcD数据分析的支持

充分利用EThcD碎片信息增加肽段定性结果可靠性