易算2018蛋白质组生物信息学系列讲座Round 2!!!
2018-08-04

易算生物2018年第二轮蛋白质组生物信息学专题讲座来啦,这次我们邀请了来自质谱数据分析专家,PEAKS软件的CEO单宝珍博士为我们带来最新的技术进展。

本次专题讲座分两场,欢迎参加,不报名、不收费!!!

主讲人:

单宝珍

博士 CEO

Bioinformatics Inc

第一场:高通量、高灵敏的免疫多肽组学数据分析软件的开发

T细胞能够通过MHC(major histocompatibility complex)分子识别疾病特异性的抗原/肽段,在下一代免疫疗法中扮演着关键性的角色。关于人白细胞一类和二类抗原(HLA)肽的完整认知对设计新的癌症和其他疾病的诊断疗法至关重要。目前质谱正逐渐被用于探索人免疫多肽组的研究,但样品纯化及数据分析方法还处于研究的早期阶段,面临各种各样的困难。本次讲座我们将介绍PEAKS开发的全新的高通量、高灵敏度的基于DDA/DIA采集方式的质谱免疫肽鉴定方法以及PEAKS新版本新功能介绍。

地点:清华大学人环楼一楼会议室

时间:2018年8月4日上午10点

邀请人:邓海腾 教授

第二场:基于深度学习算法的DIA数据de novo分析

Data-independent acquisition (DIA) 技术采用同时碎裂所有母离子的方式进行MS/MS谱图采集,可以改进肽段的检测灵敏度及通量。但是由于其碎片谱图的来自于一系列m/z相近的母离子,其高度复杂性提高了数据分析的难度。目前已有的DIA数据分析技术都依赖于数据库检索及谱图库的构建。在本次讲座中我们将介绍一种基于深度学习算法的DIA数据的e novo鉴定方法。该模型混合了用于DIA谱图的碎片强度学习的卷积神经网络算法及用于肽段的序列模式识别的循环神经网络算法。和传统算法相比,我们的新策略更为简单且分析时间与DIA谱图中包含的肽段数量成线性正比。

地点:复旦大学医学院明道楼二楼会议室

时间:2018年8月7日下午2点

邀请人:乔亮、张炜佳 研究员

上一篇: [上一篇] 没有了