PEAKS Online
2019-09-30

最新PEAKS ONLINE X给您带来最便利、最高通量的蛋白质组学数据分析流程

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简介

PEAKS ONLINE基于WEB界面为您提供最便利的质谱数据分析解决方案。基于高性能、集中式运算的数据运算服务器与低配置要求,甚至手机浏览器都可以使用的web客户端访问方式,为拥有海量质谱、多用户分析需求的实验室提供了最佳的解决方案。

PEAKS ONLINE支持多用户、多任务同时提交、分析、查看,支持De Novo,定性、定量数据分析,支持Thermo、Sciex、Bruker质谱数据。


在服务器性能足够的情况下,PEAKS ONLINE可以分析任意多的质谱数据,少到单个样品鉴定,多到上千样品的定性、定量或者NCBI nr全库分析均手到擒来。

PEAKS ONLINE部署方式

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通过客户端电脑/手机(绿色)进行任务提交和查看;通过服务器端(蓝色)集中管理数据和计算,PEAKS ONLINE支持单机部署(即任务分发、数据存储和分布式计算均在一台高性能计算机上完成)也支持分布式计算(即任务分发、数据存储管理和计算由不同计算机分别完成)


分析功能

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业界领先的 de novo 分析功能

PEAKS是目前de novo分析多肽及无蛋白序列数据库样品的最佳选择,PEAKS ONLINE更是将分析速度和通路提升到了前所未有的高度。 在De novo 功能的帮助下,常规多肽数据库鉴定的结果也能够得到更高的灵敏度和更低的假阳性率。

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高灵敏、高准确性的数据库搜索

蛋白质组学分析中的数据库搜索部分是最标准的分析谱图和序列数据库匹配的流程。同时也是PEAKS ONLINE中的重要功能。在分布式计算的加持下,海量数据、日益臃肿的NR全库、非酶切多肽分析都不在话下。

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先进的Post Translational Modification搜索

Post-translational modifications (PTMs)翻译后修饰在蛋白质组学研究中的重要性不言而喻。更高精度和更高灵敏度一直都是相互妥协而孜孜以求之的目标。PEAKS是目前唯一商业化的高通量组学级别鉴定和定量未知翻译后修饰的软件。在De Novo算法帮助下,更高的精度和灵敏度一致是PEAKS PTM模块的显著优势。

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序列标签同源搜索(突变分析)

我们检测的生物学样本往往其蛋白序列和理论数据库有所出入,不管是发生了突变还是抗体蛋白的多样性,亦或是数据库本身序列的错误均会导致鉴定失败。忽略这些问题会使得分析结果覆盖率降低甚至于遗漏潜在的生物标志物。PEAKS基于De Novo算法进一步提供了突变分析,让隐藏的序列无处躲藏。

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标记和非标记定量

目前组学研究最重要的目的便是寻找不同状态下肽段、蛋白、翻译后修饰水平的变化,PEAKS定量模块可以联用数据库搜索、PTM分析、突变分析结果进行快速、精确的标记和非标记定量,整个过程完全自动化。可以进行定量的类型包括:

ITRAQ,TMT(MS2,MS3),DDA 非标记定量,即将支持DIA,DIAPASEF等全新方法。


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