悟空分析平台
2018-09-18

https://www.omicsolution.org/wu-kong-beta-linux/main/

悟空数据分析平台是与iOmics Cloud平台的前身,也是它的平行“开发版”,平台目前主要功能是引入各类数据分析相关的R工具,为iOmics开发beta版本工具并收集用户反馈。 现在已经涵盖了数据清洗、 统计分析、 功能分析、可视化、 机器学习等各个层面,具备了共49个大类模块功能。除了 iOmics Cloud平台中的工具以外,你可以在这里找到更多的统计模型和分析工具,如WGCNA流程化处理、宏基因组Tax4Fun功能预测、回归诊断、 各类逻辑回归、决策树分类、助推法分类、激酶-底物富集分析、气泡图、 小提琴图等功能。

悟空平台分析工具一览


统计分析工具功能分析工具

•      主成分分析( PCA)

•      典型相关性分析( CCA, Canonical Correlation Analysis )

•      正规化典型相关性分析( Regularized Canonical Correlation Analysis )

•      偏最小二乘法判别分析( PLS-DA)

•      基于正交信号校正的偏最小二乘判别分析( OPLS-DA)

•      OPLS-DA分析(可针对多组样本)

•      类别变量软独立建模( SIMCA)

•      层聚类分析( HCA)

•      MFUZZ分析

•      Kmeans2分

•      假设检验

•      p值校正

•      功效分析( Power Analysis )

•      生存分析之求样本量

•      时间序列数据分析( Time Course)

•      关联规则分析( Association Rules )

•      层次分析法( AHP)

•      标准化+桂状图

•      ID号查询

•      ID号转换

•      GO富集分析

•      GO富集分析(自己上传背景库)

•      KEGG富集分析

•      基因组KEGG通路图( KEGG Pathway )

•      代谢组KEGG通路图(KEGG Pathway)

•      String网络图

•      代谢物富集分析( Metabolites pathway over-representation test )

•      代谢物确定( LC MS Search )

•      多组学富集分析(蛋白质组和代谢组)

•      序列比对KEGG分析

•      序列比对 GO分析

•      激酶 - 底物富集分析( Kinase-Substrate Enrichment Analysis )

•      宏基因组Tax4Fun 功能预测

可视化工具

其他工具

•      韦恩图(Venn)

•      交集图(Upset Plot )

•      雷达图(Radar)

•      火山图(Volcano)

•      定量信息图

•      相关性图(Correlation )

•      相关性图第二种

•      相关性网络图

•      两矩阵间的相关性图

•      树枝图(Dendrogram )

•      画Motif图

•      词云(WordCloud )

•      带边缘密度的散点圄

•      气泡图(Bubble Plot )

•      小提琴图

•      箱线图

•      数值分布图(小提琴图变种)

•      带圈的散点图

•      ROC曲线

•      堆叠连线柱状图

•      概率密度曲线分布图

•      Google Scholar R

•      Sci-hub文献查询

•      PubMed查询与分析

•      Googlefilter R

•      监控CRAN官网函数包

•      书籍搜索

•      回归分析

•      监督学习模型

•      非监督学习模型

•      PDF图片格式转换

•      WGCNA分析

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