多肽组学研究方法
2018-12-11

生物学活性多肽是指在生物机体的生命活动过程中具有多种生物学功能的多肽,包括信号分子(例如细胞因子、生长因子和肽激素),抗菌肽以及功能未确定或来自疾病特异性酶切的其他小蛋白碎片及肽段,分子量最高达30 kDa。这些小分子肽被越来越多的研究证实具有重要的生物学意义。

多肽组学(peptidome),即通过多种方法系统、全面、定性及定量的研究从特定时间和位置获取的生物样本中的内源性肽段的一门学科。多肽组学在组学研究领域具有重要作用,是对蛋白质组学的补充,是蛋白质组学和代谢组学之间的桥梁。通过多肽组学可以更好地理解蛋白酶的功能和消化过程,寻找具有生物学意义的多肽标志物,筛选具有生物学活性的潜在治疗药物。

多肽组学研究流程

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技术优势

应用领域


Ø非抗体依赖,肽段检测无偏向性,通量更高; 

Ø可同时进行肽段的序列鉴定及定量分析; 

Ø基于高精度质谱,更高的分辨率、灵敏度和重复性; 

ØDe Novo方法既可以鉴定已知肽段,也可以检测未知肽段,寻找新的活性肽。

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应用案例解析

案例来源:Parker BL, Burchfield JG, Clayton D, et al. Multiplexed Temporal Quantification of the Exercise-regulated Plasma Peptidome. Mol Cell Proteomics. 2017;16(12):2055-2068.

实验目的:锻炼对人血浆多肽组学的时效性影响

实验方法:收集5个时间点的人血浆样本(20),进行多肽组学分析,并对这些多肽参与的水解反应进行生物信息学分析。

实验结果:鉴定到6652个肽段,552个蛋白group,多肽的酶切位点map到94个上游蛋白酶。

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