PEAKS AB
2018-11-20

单克隆抗体在生化分析、 医药研发、 临床诊断和疾病治疗中有着广泛的应用。抗体的一级结构,尤其是CDR区的氨基酸序列与其生物活性密切相关。 因此,对于单抗药物研发来说,获得单克隆抗体准确无误的完整蛋白序列信息具有极其重要的意义和价值。

PEAKS AB是专门针对生物药研发开发的一款质谱数据分析软件,颠覆性地为生物制药企业用户及抗体蛋白研究工作者提供了全新的表征策略:在毋需提供参考序列的情况下,可以通过多酶酶切实验结合De Novo测序功能实现对于未知蛋白的准确测序,同时能够得到传统药物表征解决方案可以提供的抗体精确分子量、N-糖基化修饰位点/占据比率、PTM修饰 (氧化/脱酰胺化…)、二硫键配对等信息,全面打造具有突破性的生物制药质谱表征平台。

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基于 PEAKS AB的单克隆抗体全长 De Novo 测序

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PEAKS AB 的 Intact MS 模块


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崭新的去卷积算法,可获得更为精确的分子量匹配和强度信息

内置常见修饰,自动进行谱峰标注

联合 de novo sequencing 结果,蛋白层面辅助解析罕见加合物

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您只需进行如下三步简单操作,其余的,全由 PEAKS AB帮您完成!

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PEAKS AB 准确解读 EThcD 碎裂模式下的亮氨酸/异亮氨酸差异


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PEAKS AB 2.0 将不同碎裂模式下的二级谱图进行整合展示

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PEAKS AB的打分基础:EThcD 碎裂模式下肽段N端亮氨酸/异亮氨酸所产生的特征w离子


PEAKS AB 特有的 PTM Profiling 模块功能

在PTM Profiling 模块下您只需勾选任意可能存在的修饰,并在肽谱图结果展示时选择 PTM Profile,则会在肽谱图界面展示所有可能的PTM。

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PTM Profile 模块在结果展示界面会详尽的展示出任何一个PTM的相关信息

1. 特定位点上翻译后修饰的比例=modified area/(modified area + unmodified area)*100%

2. 修饰/未修饰的所有 PSM 相关信息 (Scan、流出时间、-10lgP、Area等)

3. 二级谱图碎片离子标识、提取离子流色谱图和 feature 展示

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PEAKS AB 的二硫键解析模块

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PEAKS AB 2.0新增的二硫键解析模块只需勾选Detect disulfide bonds,则会在肽谱图界面同时展示包含二硫键的肽段,并在相应的二级质谱图中给出其碎片离子的标识。

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信息丰富的 PEAKS AB 肽谱图结果界面展示


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PEAKS AB 软件在搜库设置时包含传统路线的抗体序列验证和全新一代的序列未知抗体结构解析两条路线,在最终的肽谱图结果展示时除了肽段置信度得分外,还有精确到每个氨基酸残基的位点置信度得分,高可信度的de novo tag和翻译后修饰位点标识,自动化错误序列更正及位点突变信息展示等。

PEAKS AB 软件拥有更为用户友好的界面设置,用户可以自定义抗体各个功能结构域氨基酸起始位置,自由改变不同酶切PSM标识颜色。

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