下一代非标记定量蛋白质组学

我们提供一系列基于质谱的生物样本数字化产品,助您迈向蛋白质组学的下一时代。通过我们集成的整体解决方案,您可以轻松地实行各种蛋白质组学研究流程。取决于您的研究方向,可以选择发现式研究方案,剖析不同条件及处理下样品的成千上万种蛋白;亦或是靶向研究方案,对选定的蛋白质进行高通量定量。

发现式蛋白质组学

超反应监测(HRM, Hyper Reaction Monitoring)是发现式蛋白质组学中最新的一类技术。它能够提供无与伦比的蛋白质组覆盖,同时实现每个样品9000种蛋白质(人类细胞)的精确、高度可重复的定量。HRM流程提供一个理想的差异表达蛋白质组定性分析或海量样品的蛋白质组定量平台。

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HRM流程基于三个必要步骤:
• 构建谱图库:图库收集了样本所有可检测的非冗余的高质量肽段信息(MS/MS谱图),用于后续数据分析的肽段鉴定模板。其中包含描述肽段谱峰特性的碎片离子强度和保留时间 (iRT)。谱图库通过对感兴趣的样品进行data dependent acquisition (DDA)检测采集。
• DIA模式下获取大量样本数据:Data independent acquisition (DIA,又称 SWATH)模式利用最新的高分辨质谱实现在质量数和保留时间上同时采集肽段离子特征。与传统的提取单一离子进行碎裂分析的方法相比,DIA模式下质谱被设定为宽母离子窗口循环采集并同时碎裂多种肽段离子的分析方式。实现了将样品中所有可检测的蛋白谱峰信息完整采集, 从而能够高重复性的分析大量样本。
• 数据分析:在基于DIA的发现式的蛋白质组研究中,如何更好地进行蛋白检测和定量目前依然是个巨大的挑战。采集自肽段的信息虽然十分完整,但发生高度卷积。我们可以利用高质量谱图库中的肽段谱峰进行进行分析,但在统计分析和定量前,必须首先进行有效地去卷积。而这一步操作目前完成的最好的软件即为Spectronaut

HRM之于常规“shotgun”蛋白质组技术的优势在于可以在单次检测实验中对所有可检测的肽段进行高灵敏高精确度的进行定量。HRM实验结果是一个简单而完整的数据矩阵,包含了各个样品中各蛋白的精确定量信息,从而各种背景的研究者都能直接用其进行深度解析而不需要质谱专家的辅助。HRM进一步能够将一个物理样品转换成数字化蛋白质信息库,这意味着在之后的研究中,我们可以随时对数据进行回溯和重新解析,而不需要再次对其进行数据采集。

我们的发现蛋白质组学解决方案整合了Biognosys公司的Hyper Reaction Monitoring (HRM-MS™),可在一次实验中以DIA模式(DIA或SWATH)精确定量大量蛋白。实验套装可无缝衔接HRM实验流程的各个环节。

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相关试剂请参照:
iRT试剂盒
HRM校准试剂盒
Sample Preparation试剂盒Pro
Sample Preparation试剂盒
PlasmaDive™ MRM组件
PlasmaDeepDive™ MRM组件
PlasmaDive™ Mini MRM组件

相关软件请参照:
Spectronaut™
SpectroDive™

更多信息及分析案例请参考以下资料:
靶向蛋白质组介绍
PRM靶向定量方案介绍
HRM超反应监测
Targeted Proteomics Course 2016