自上而下的(Top-Down)蛋白质组学

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自上而下的(Top-down)质谱分析法是表征完整蛋白的新兴手段,用于分析由完整蛋白酶切或化学裂解的肽段。该方法与自下而上(bottom-up)(也称为鸟枪法)的分析法相反。目前自下而上的策略是鉴定蛋白质、表征翻译后修饰甚至是相对及绝对定量最为成熟且广泛使用的工具。然而同时,自下而上策略的应用也受到其内部缺陷的限制。

自上而下的蛋白质组学中,完整蛋白首先通过PAGE或免疫富集法从复杂的生物样本中分离,然后直接用电喷雾电离(ESI)或激光基质解吸电离(MALDI)技术生成离子。生成的离子经碰撞诱导解离(CID)、高能量碰撞诱导解离(HCD)、电子捕获解离(ECD)或电子转移解离(ETD)等方式碎裂,并在串联质谱中分析。该方法是蛋白鉴定、分析、序列解析及翻译后修饰表征方面另一个有前景的策略。

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基于自上而下策略的序列解析
基于自上而下策略的翻译后修饰表征
蛋白质结构表征