蛋白质结构表征

characterization-of-protein-structure

自下而上策略的应用主要受限于:不能够完整或明确表征可变拼接形式、多样化修饰及蛋白内源酶切。作为替代方案,自上而下的策略因其分析仪器的进步而被更多的应用于上述需求。除了FT-ICR质谱,离子阱质谱(orbitrap)的发明和革新促进了自上而下蛋白质组学的发展。

由于分析前不需要对样品进行蛋白酶解,诸如带二硫键的四级结构这样在鸟枪法中会丢失的信息,在自上而下的策略中则会被保留并被测定,这对于在蛋白水平表征二硫键的研究来说是个独特优势。该优点使得自上而下的分析策略在蛋白药物的QC分析中(例如胰岛素)得到越来越多的应用,确保重组蛋白的正确表达、折叠和组装。