基于自上而下策略的序列解析

top-down-based-sequencing

在自上而下的蛋白质组学中,完整蛋白分子的离子经ESI或MALDI生成后进入质量分析器并进行气相裂解。自上而下的分析可直接通过观测C-端和N-末端来确定断裂的位置,并且通过不同的序列区分蛋白亚型。

和常规的Edman降解法相比,即使当末端被修饰,包括N-端乙酰化、N-端焦谷氨酸化、序列截断及存在信号肽,我们也能够借助自上而下的策略利用MALDI-ISD质谱提供N-端和C-末端序列的解析服务。分析也可以用于表征蛋白降解和酶切。自上而下的策略可以保证完整蛋白上自N-末端或C-末端起20到80个残基的分析。