蛋白-蛋白相互作用

protein-protein-interaction

在所有核心的生物学过程中,蛋白在分子识别中发挥着重要作用。它们与其他细胞成分相互作用,如小分子代谢物、核酸、膜和其他蛋白,以此构建超分子体系,组装能够行使各种功能(从化学催化到机械工作到信号调控)的分子机器。作为其中最重要的相互作用,人类已经对蛋白-蛋白相互作用展开了广泛研究。目前蛋白相互作用已经被大规模的鉴定,产生的所有数据都被收集到专门的数据库中,使得绘制大型的蛋白相互作用网络成为可能。

就像代谢或遗传/表观遗传网络,蛋白-蛋白相互作用(PPIs)的研究可以帮助我们理解信号传导、跨膜转运、细胞代谢机制和其他通过稳定或瞬间、共价或非共价相互作用调节的生物学过程。

储存在PPIs数据库,比如DIP (蛋白相互作用数据库,Database of Interacting Proteins)、BIND(生物分子相互作用网络数据库,Biomolecular Interaction Network Database) 和KEGG (京都基因和基因组百科全书,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 中的信息,可以用于建立蛋白-蛋白互相作用网络。通过自己开发的软件,我们可以通过对假定的相互作用的可信度进行打分,帮您建立并可视化一个更可靠的PPI网络。

我们也可以运用蛋白注释信息提供高级数据挖掘服务,如:
1. 蛋白相互作用位点预测;
2. 蛋白相互作用可靠性评估;
3. 为参与病理学/生理学过程的特定蛋白质集合建立相互作用网络。

您可以点击以下链接找到相应的介绍:

免疫共沉淀法(co-IP)
蛋白质体外结合实验Pull-Down Assay
交联蛋白相互作用分析