单克隆抗体是生物医药领域的重要工具,广泛应用于疾病预防、诊断和治疗,特别是在癌症和自身免疫病的治疗中发挥着关键作用。在这个背景下,基于质谱的单克隆抗体测序技术显示了其独特和关键的价值: 抗体分子的一级结构,尤其是CDR的氨基酸序列,对于抗体的疗效和安全性至关重要
查看原始文章来源 ↗单克隆抗体是生物医药领域的重要工具,广泛应用于疾病预防、诊断和治疗,特别是在癌症和自身免疫病的治疗中发挥着关键作用。在这个背景下,基于质谱的单克隆抗体测序技术显示了其独特和关键的价值: 抗体分子的一级结构,尤其是CDR的氨基酸序列,对于抗体的疗效和安全性至关重要
基于质谱的从头(De Novo)测序技术,利用高精度和高分辨率的质谱设备,可以直接对单克隆抗体蛋白、甚至特异性多克隆抗体进行氨基酸序列解析。这种方法的特点是,它不依赖于传统的蛋白质数据库搜索或核酸编码序列,直接获取未知序列的单抗一级结构, 也可与B细胞受体库测序(BCR-Seq)相互结合互为补充
我们平台的多酶切结合De Novo测序技术,积累了多年的经验,并拥有专业的分析团队: 我们可以提供单抗样本包含序列信息、CDR区标识、精确到氨基酸残基的位点置信度、翻译后修饰信息: 一级结构信
对客户提供的单抗样品进行多酶酶切,酶切后的抗体肽段采用超高分辨率 质谱 Eclipse进行数据采集,选择不同的碎裂模式(HCD/ETD/UVPD),得到的谱图信息可以通过De Novo算法自动化测序和组装序列,最终对序列进行完整分子量确证,得到准确的抗体一级结构信息 多抗样本需进一步沟通可行性和研究难度
服务流程 测序周期短、成本低、成功率高
样本要求 全面、准确获取抗体序列信息,不受抗体物种的限制
1. 高质量结 采用至少5种不同的蛋白酶进行多重酶切,以确保单抗分子轻重链:00%全序列覆盖。此方法通过多种酶切肽段的互补性,实现完整序列的精确拼接。由下图 看出,同一个氨基酸位点至少鉴定到了10种不同的肽段,保障测序结果的高准确性。此 ,每个氨基酸在肽段二级质谱图中展示出强的离子片段峰,结合碎片信息和分子量差异可以精确区分到每一个氨基酸。这些高质量的结果说明我们提供的单抗测序的高可靠性
基于质谱的单抗测序高质量结果
2. 高性能设备 单抗测序我们采用 最新型三合一全能质谱 Eclipse 可显著提高单抗测序的准确性、效率和深度:)超高分辨率和高精度,可以准确鉴定相近质量的肽段和修饰,确保抗体序列的分析结果更为精确,有助于准确识别抗体中的微小变异和复杂的翻译后修饰:)多种碎裂方式,支持HCD、ETD、UVPD等,增强序列覆盖和准确性:)强大的灵敏度和广泛的动态范围,能够检测到极低丰度的肽段,确保序列的全面覆盖:)高效的数据采集,相比老一代Lumos和Fusion采集速度快,有助于缩短项目周期,加速研究进程
我们搭建了完整的上下游板块,不仅可以前期利用质谱及De Novo算法对单抗进行序列解析,后续还可 使用瞬时表达系统快速高效实现蛋白表达,以供初步验证;同时构建稳转细胞株,实现蛋白质抗体的量产
服务方案 - 基于质谱的单抗从头测



