质谱蛋白组与多组学定制分析
易算生物围绕组织异质性、细胞状态、代谢变化、标志物发现和治疗随访等研究问题，提供质谱检测与定制生信分析。根据样本来源、分组方式和临床信息组织分析，以图表与报告呈现组间差异、定位候选分子，并为后续实验和研究设计提供依据。
研究专题
易算生物提供质谱检测和定制生信分析，服务包括空间与单细胞蛋白组、蛋白组与代谢或磷酸化联合分析、宏蛋白质组，以及临床队列、标志物和纵向随访研究。可在采样前安排检测与分析，也可对已有组学数据补充专题分析。
空间组织与微环境
保留病理区域与坐标，研究局部蛋白差异、空间过渡和候选通讯关系。
目标区域 ROI 蛋白组
结合病理标注与激光显微切割，比较病灶、邻近组织、上皮、基质等目标区室的蛋白组成。适合已有明确病理区域，需要研究区域差异及其在独立患者中一致性的课题。结果包括ROI图谱、配对差异、功能特征和区域相关候选蛋白。
研究场景与分析内容 →连续空间梯度蛋白组
沿距离、组织轴向或预设位置连续取样，估计蛋白丰度随空间位置的变化方向、幅度和主要区段。适合器官分区、病灶边缘及结构过渡区研究，结果包括梯度蛋白统计、变化模式分组、功能分析及代表蛋白轨迹。
研究场景与分析内容 →网格空间蛋白组
基于规则网格或密集ROI取样，按蛋白特征划分区域，再用原始组织坐标显示各分区的位置和邻接关系。适合研究切片中的分子异质性及区域界面，结果包括网格丰度图、分子分区、区域标志蛋白和界面差异。
研究场景与分析内容 →空间细胞通讯与微环境
对有细胞富集标记的病理区域开展蛋白定量，比较免疫浸润区、肿瘤基质或血管周围区域的蛋白状态。将测得蛋白与配体受体数据库匹配，筛选候选分子组合，逐项列出细胞富集类别、组织位置及相应区域的蛋白丰度。
研究场景与分析内容 →单细胞与细胞状态
以细胞刻画异质性，以独立样本比较组成与同类细胞的响应。
队列与跨组学研究
结合临床表型、代谢、磷酸化、微生物及组织—体液配对关系。
队列蛋白组与患者分层
围绕患者配对组织、病理分级和临床表型开展队列蛋白组分析，估计患者内组织差异、蛋白与临床指标的关联、共表达模块及患者分型。结果同时报告队列平均变化、个体差异和重点蛋白的功能注释。
研究场景与分析内容 →蛋白组与代谢组联合分析
在配对样本中分别分析蛋白和代谢物变化，结合酶、底物、产物及转运关系开展跨组学关联和反应网络分析。适合代谢重塑、干预响应和机制研究，结果列出候选酶与代谢物组合及其反应关系，供靶向复测、酶活性或同位素示踪实验选择对象。
研究场景与分析内容 →蛋白组与磷酸化联合分析
同一批样本分别完成全蛋白与磷酸化检测，比较位点变化及其母体蛋白丰度，利用已知底物位点推断激酶相关信号。可研究药物响应、信号调控及耐药过程，报告蛋白与位点差异、母体蛋白调整结果、激酶推断和候选底物。
研究场景与分析内容 →宏蛋白质组与微生物功能
研究复杂微生物群落中实际检测到的蛋白表达及功能组成，结合宏基因组、代谢组和宿主表型开展联合分析。适合微生态、营养干预及群落功能研究，结果涵盖微生物来源、功能蛋白、共同模块与多组学关联。
研究场景与分析内容 →组织与体液联合蛋白组
在配对患者中比较病灶组织与体液蛋白的变化和相关性。研究分为病灶标志物、候选定位、局部与全身反应、组织分型、治疗耐药及进展复发六类方向，各自配置组织取样、体液采集和随访。病理资料用于确定局部区域及蛋白位置，临床资料用于人群比较、关联分析或预测评价。
研究场景与分析内容 →体液与临床标志物
围绕患者分组、诊断、预后和连续随访开展科研分析。
体液蛋白组队列分析
血浆、血清及其他目标体液的队列分析包括定量覆盖、组间差异、患者内配对变化和临床关联。疾病相关蛋白同时报告群体效应与个体分布；已有治疗前后样本时，可直接比较患者内的变化，并汇总共同响应及其涉及的功能过程。
研究场景与分析内容 →诊断生物标志物
以早期疾病识别或相似疾病鉴别为目标，在相应病例和对照中筛选蛋白组合。比较蛋白模型、常规临床指标与联合模型，报告区分度、概率校准及不同阈值下的灵敏度和特异度。选定组合后，可进一步评价减少检测蛋白数量后的表现，以及独立队列中的分类性能。
研究场景与分析内容 →预后蛋白与风险模型
将基线蛋白与后续事件时间和结局相联系，研究预后相关蛋白并比较临床、蛋白及联合模型。结果包括候选稳定性、时间相关区分度、校准和预测误差，支持风险分层及后续验证设计。
研究场景与分析内容 →纵向体液蛋白组
同一患者的连续体液采样可用于分析治疗期间的蛋白轨迹，比较共同时间变化与不同治疗组的响应差异。分析按实际采样时间和患者编号组织，报告访视覆盖、蛋白动态效应、组别与时间的交互，以及变化集中的时间窗。
研究场景与分析内容 →单细胞蛋白组交互分析 Demo
从细胞分布到蛋白差异，查看可筛选、可定位的单细胞实例结果。SCP ANALYSIS 支持二维与三维细胞分布、细胞簇与实验组筛选、蛋白检索、单蛋白分布，以及蛋白差异与功能相关结果的联动查看。
- 细胞分布与数据覆盖：旋转或切换二维视图，按细胞簇或实验组筛选，查看单个细胞及其蛋白检出信息。
- 蛋白检索与差异：搜索候选蛋白，分别观察检出比例和已检出细胞中的丰度；Fabp1 与 Acaa2 的示例用于比较这两类变化。
- 共同变化与功能解释：结合主成分、功能集合及成员蛋白，追踪统计结果对应的具体分子。
该匿名示例包含 603 个细胞，合计涉及 4,556 个蛋白；这里的总数不是单细胞检测深度或服务性能承诺。SCP ANALYSIS 是独立 Demo，与本专题中的公开数据再分析案例分别展示，不混用样本规模或结论。
服务概览
服务特色
根据研究问题设计分析
在样本采集前讨论研究目标、分组与采样安排；对已有检测结果，结合数据质量和配套资料评估补充分析。配对组织、独立患者队列、单细胞取样和重复随访分别采用适配的数据处理与比较方法。
保留组织位置和细胞差异
空间蛋白组结合病理区域和坐标定位局部变化，单细胞蛋白组描述细胞群及其蛋白状态。以患者、动物或独立培养实验为单位开展组间比较，在区域和细胞层面进一步分析样本内的异质性。
将多层数据用于候选筛选
结合临床表型、其他组学及已知生化关系，开展跨层关联、功能模块和候选模型分析，用于筛选候选分子、解释功能变化，并为后续验证实验提供研究线索。
核心技术优势
针对复杂分组、空间取样、单细胞和纵向随访等数据结构，选择相应的统计分析方法。空间区域与细胞状态分析结合组织和个体信息，蛋白与代谢联合分析结合已知反应关系，体液标志物分析将临床变量纳入模型比较。交付专题报告、结果表及可用于汇报和论文准备的图件。
服务流程
易算生物分析示例
分析示例
图文为分析方法、公开数据再分析或研究示例。示例中的样本数量、效应和模型性能对应各自数据与分析条件，不代表其他项目的结果保证。服务用于科研；候选关系与预测结果不能替代机制验证、独立队列验证或临床诊断。
空间蛋白组的分子分区
对网格取样的蛋白表达进行分群，再将分群结果对应回组织坐标，观察分子分区及其邻接关系；结合病理标注，可进一步比较病灶、基质、侵袭前沿等区域的蛋白特征。
易算生物分析示例
单细胞蛋白组的细胞类别图谱
根据单细胞蛋白表达建立细胞图谱，结合标志蛋白与已有注释区分主要细胞群，并在同类细胞中研究疾病或处理相关变化。
易算生物分析示例
蛋白与代谢变化的反应层解释
分别分析蛋白和代谢物变化，再按酶、底物、产物及转运关系组织结果，定位同一代谢过程中的多层变化。样本配对时可进一步评价跨层相关性，筛选酶与代谢物组合，为靶向复测、酶活性或代谢通量实验提供候选。
易算生物分析示例
多组学共同变化与主要贡献特征
在样本对应的多组学数据中，可采用多组学因子分析（MOFA）提取主要变化轴，分别评价各数据层被解释的变异及高权重特征。随后结合临床分组和分子注释，研究这些变化轴对应的表型与生物过程。
易算生物分析示例
纵向体液蛋白组的治疗响应
对同一患者的基线和后续体液采样开展纵向比较，以患者为重复测量单位，分析蛋白随访视时间和治疗条件发生的变化。结合疗效分组，可进一步研究治疗过程中持续变化、短暂变化或组别相关的蛋白响应。
易算生物分析示例
纵向分析交付不同时间点的变化结果、组别与时间交互效应及候选蛋白轨迹，以效应估计和轨迹图呈现变化方向与幅度。结合临床疗效资料，可评价蛋白变化与疗效分组之间的关联，为选择复测蛋白和后续采样时间点提供依据。
体液预后模型的评价
具有基线采样、随访时间和结局记录的体液队列，可用于研究基线蛋白与后续事件风险的关系。分析比较临床变量模型、蛋白模型及联合模型，评价风险区分能力、校准及预测误差，并根据队列条件设计独立验证。诊断研究则围绕病例定义和相关对照开展分类与验证。
易算生物分析示例
典型应用领域
服务适用于肿瘤与组织异质性、代谢调控、临床标志物及治疗随访研究。空间与单细胞分析用于定位区域和细胞状态差异，多组学分析用于研究跨层关联及功能变化；具有组织与体液配对样本时，可在配对患者集合中评价跨样本类型关联，并结合病理信息解释候选来源。
项目资料与交付结果
客户提供样本、分组和相应病理、临床或实验信息，易算完成质谱检测及专题分析。交付包括质量概览、专题分析报告、结果表、图件及主要方法说明，可根据研究需要讨论靶向复测、组织定位或独立队列验证。
服务方式与交付
项目可从采样前的研究设计开始，也可使用已有检测结果开展补充分析。检测安排取决于组织或体液类型、主要比较、配对结构及可用材料。病理标注用于确定取样区域，临床和随访资料用于分组、协变量校正或预测评价；配套组学数据按样本对应关系开展关联分析与功能解释。
交付包括约定的检测与定量结果、专题分析报告、结果表、图件及主要方法说明，附样本信息、统计结果和图注。同一项目含多个专题时，各报告沿用统一的样本编号，并注明每项结果使用的样本范围和比较条件。
项目咨询
请提供研究问题、样本类型与数量、分组方式，以及已有的病理、临床、随访或配套组学资料。已有检测结果可附报告目录或数据字段说明。
邮件咨询 · multiomics@omicsolution.com