交联质谱分析的报告结果,我们主要提供以下部分内容: 1)电泳检 测: 通过电泳选取最佳交联样本,后续用于质谱分析。
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1)电泳检 测: 通过电泳选取最佳交联样本,后续用于质谱分析。
我们以纯化蛋白BSA为例,加入交联剂进行交联反应,然后SDS-PAGE跑胶。 如下图所示,与不加交联剂的对照样本相比,1-8为不同反应条件的交联蛋白, 从左到右随着交联剂与蛋白的浓度比例增加,蛋白逐渐发生交联,原先分子量位置上蛋白条带明显减少,大分子区域的蛋白条带明显增加,说明交联实验成功。
交联反应后SDS-PAGE检测
2)搜库鉴定: 统计 在5%FDR条件下,鉴定到的交联肽段、交联位点和交联谱图数量。这些是指交联剂两端交联两条肽段(cross-link)的结果。此外,还会提供交联剂两端交联同一条肽段(loop-link),或交联剂只一端交联(mono-link),没有交联的常规肽段(regular-link)的结果。
交联质谱搜库鉴定结果统计
3)详细的交联鉴定表 。包括交联蛋白、交联序列及交联位点等信息,即,蛋白A的b位点和蛋白C的d位点交联,质谱检测有交联位点的蛋白,可能就是互作蛋白或者形成多聚体。
4)交联肽段的高质量谱图。 交联 肽段经过质谱高能碰撞解离后产生一系列肽段碎片离子,彩色标记的峰为质谱检测到的碎片离子,彩色覆盖越多,结果越可靠,因此是评估鉴定结果质量的直观方式。
交联肽段 高质量 谱图匹配
5)交联位点可视化。 可视化蛋白相互作用位点,或复合物内部区域的交联情况。绿色实线表示 蛋白-蛋白间的交联,即两个蛋白间的互作;紫色实线表示某个 蛋白构象上的自交联,可能是两条肽段分子间交联,也可能是一条肽段分子内交联 。总之, 交联质谱的结果可以与冷冻电镜等技术并行使用,以获取蛋白复合体三维 结构信息。
服务报告 - 交联质谱demo报告



