这里介绍 多肽组学 是基于LFQ定量的分析内容， 常规定量蛋白组分析内 基本一样，只是多肽组结果是肽段水平定量，而蛋白组提供的是蛋白定量结果。PS：如： 不做定量 只做多肽鉴定，分析内容可参 蛋白鉴定报告
查看原始文章来源 ↗这里介绍 多肽组学 是基于LFQ定量的分析内容， 常规定量蛋白组分析内 基本一样，只是多肽组结果是肽段水平定量，而蛋白组提供的是蛋白定量结果。PS：如： 不做定量 只做多肽鉴定，分析内容可参 蛋白鉴定报告
以下内容为LFQ定量多肽组学的demo报告
基于定量到的总体肽段，我们可以进行PCA和PLS-DA分析，若样本相似，那么它们在图上显示时会彼此接近，如果样本异质性较大，那么它们在图上会彼此远离，以此来评估组内样本重复性或组间样本差异性
针对定量到的肽段进： 筛 差异肽段，默认是样本组别两两比较，首先计算每个肽段在 样本 分组中的相对定量值平均值，然后计算两个分组定量均值的比值即为差异倍数（Fold Change, FC）。同时通过T-test检验计算p-value来判断差异的显著性（若样本无生物学重复，则无法进行T-test 检验，即没有p-value值；当需要多组比较分析时，差异肽段筛选通过anova检验计算p-value来判断差异的显著性，没有FC值）
基于FC和p-value筛选到在实验组_vs_对照组的上调和下调表达差异肽段， 得到差异肽段的数据。然后火山图可视化两组中差异情况，红色为上调肽段，蓝色为下调蛋白，灰色为非差异，每个点代表一个肽段。聚类热图可视化差异肽段在不同组/样本中的表达和聚类情况，红色表示上调，蓝色表示下调，根据表达模式可以对样本和肽段分别进行相似性聚类
接下来进行功能分析，进一步了解差异肽段在哪些功能和通路中富集： 该部分内容是基于差异肽段所属蛋白进行GO功能、KEGG通路和蛋白互作网络分析，蛋白本身不考虑差异
GO功能分析：基于GO数据库，对差异肽段所属蛋白进行生物学过程、细胞组分和分子功能的注释和富集分析
KEGG通路分析：基于KEGG通路数据库，对差异肽段所属蛋白进行新陈代谢、细胞过程，人类疾病等通路的注释和富集分析
STRING蛋白互作 网络分析 展示蛋白已知或预测的相互作用信息，根据连通性等参数结果，可以寻找关键互作节点
服务报告 - 多肽组demo报告
