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多肽组学技术方案

多肽组学(peptidome): 基于LC-MS全面、定性及定量地研 从特定时间和位置获取的生物样本中的内源性可溶性肽段

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多肽组学(peptidome): 基于LC-MS全面、定性及定量地研 从特定时间和位置获取的生物样本中的内源性可溶性肽段

研究对象 多肽组学是研究生物学活性多肽的技术,包括信号分子(例如细胞因子、生长因子和肽激素),抗菌肽以及功能未确定或来自疾病特异性酶切的其他小蛋白碎片及肽段。这些小分子肽被越来越多的研究证实具有重要的生物学意

研究意义 多肽组学是对 蛋白质组 的补充,是蛋白质组学和代谢组学之 间的桥梁 通过多肽组学可以更好地理解蛋白酶的功能和消化过程,寻找具有生物学意义的多肽标志物,筛选具有生物学活性的潜在治疗药物

非抗体依赖,基于质谱,肽段检测无偏向性,通量更高

可同时进行肽段的序列鉴定及定量分析;&

基于高精度质谱,更高的分辨率、灵敏度和重复性;&

De Novo方法既可以鉴定已知肽段,也可以检测未知肽段,寻找新的活性肽

注:生物信息学分析数据库不针对所有物种,根据实际情况分析

如采用物种相应蛋白质组数据库分析

2. 多肽-蛋白匹配列表,得分,信号强度

3. 无法匹配蛋白的谱图的De Novo多肽序列及其可信度,质谱信号强度

4.& 多组样品分析可以进行非标记定量,检测差异表达的多肽种类

如无物种信息 (或认为多肽来源不是蛋白水解产物,不来自于编码基因产物等),一般可以采用De Novo方法直接检测分:-12AA长度的多肽,更长的多肽De Novo可信度大幅下降,不建议

De Novo得到的多肽序列及其可信度

质谱信号强度(非多肽含量,仅为质谱中的信号,可以粗略反应含量高低);

首先需要明确检测多肽的分子量范围,一般建议关:000Da以下:000Da~10000Da。更大分子量的建议按照蛋白操作。另外质谱检:-6个AA长度的肽段会产生较多的排列组合误判,难以降低假阳性,需要后续自行验证准确性

样品管上名称和信息单名称请务必保持一致,除名称以外,请勿将其他信息标记于管盖,以避免出现可能的识别错误

锡纸包装的组织样品,将样本名称写在标签纸上并和样品一起装入塑封袋中,避免低温冰冻造成的样本名称无法识别

多肽组学技术方案资料图 1
多肽组学技术方案资料图 1
多肽组学技术方案资料图 2
多肽组学技术方案资料图 2
多肽组学技术方案资料图 3
多肽组学技术方案资料图 3
多肽组学技术方案资料图 4
多肽组学技术方案资料图 4