在现代生物研究中，了解空间异质性和细胞异质性的蛋白质分布与表达对于揭示生物机制至关重要。空间蛋白组技术通过高分辨率地描绘组织切片中蛋白质的空间分布，帮助我们理解蛋白质如何在组织微环境中变化。这种空间信息为疾病的早期诊断和治疗提供了新的视角。与此同时，单细胞蛋白组技术允许我们在单个细胞层面深入分析蛋白质的表达和功能…
查看原始文章来源 ↗在现代生物研究中，了解空间异质性和细胞异质性的蛋白质分布与表达对于揭示生物机制至关重要。空间蛋白组技术通过高分辨率地描绘组织切片中蛋白质的空间分布，帮助我们理解蛋白质如何在组织微环境中变化。这种空间信息为疾病的早期诊断和治疗提供了新的视角。与此同时，单细胞蛋白组技术允许我们在单个细胞层面深入分析蛋白质的表达和功能，从而揭示不同细胞类型及其状态之间的微小差异。这种技术为精准医学和个体化治疗开辟了新天地。
目标：研究组织微区域异质性或细胞异质性的蛋白表达水平，为揭示生理病理表型、药物靶点的开发、及实现精准医疗都提供数据参考。
材料 空间蛋白质组：提供冷冻或石蜡组织切片，也可以直接提供组织块 单细胞蛋白质组：提供分选好的单细胞，如果是组织样本，需要我们进行单细胞悬液制备和单细胞分选，请另询
平台 特色（空间和单细胞蛋白组
平台优势：我们搭建了完整的流程方案，从精准取样，到高效灵敏样品制备，到高通量质谱采集与数据分析。
通过激光显微切割（LCM）获得组织切片微区域样本，或者通过流式分选获得单细胞样本，在快速灵敏试剂盒的前处理下，实现蛋白提取、变性、酶解和纯化等步骤；再通过高灵敏的短梯度质谱进行数据采集，实现对低input样本进行蛋白深度检测；后续对这些数据我们有完整的分析设计方案，助您深度挖掘空间/细胞异质性的病理机制与biomarker识别。
针对激光显微切割或者单个细胞水平的超微量样本，要求高灵敏、高通量的前处理，我们的样本制备方法具有如下优势：
快速高灵敏：将微量与快速前处理方法结合，实现了单细胞尺寸样本快速蛋白前处理，总处理时间不到1.5h；
高通量：整合到96孔板中实现高通量样本前处理，可用于大规模样本分析；
“0”损耗：ABC三个步骤，从组织/细胞到上机肽段一管操作；
适用场景广：适用于临床医生易获得的组织切片样本，以及流式分选的单细胞。
尖端色谱质谱联合DIA技术
目前最佳的高灵敏、高通量LC-MS方案就是IonOpticks Aurora 3系列色谱柱 + timsTOF HT/Ultra和Astral质谱仪 + DIA采集 + Spectronaut软件。IonOpticks Aurora 3系列色谱柱的高分离能力确保了复杂肽段的有效分离；timsTOF HT/Ultra和Astral质谱仪的低input和短梯度（8/15min）满足了高通量的检测需求；DIA全息采集方式提供了更全面的数据，尤其是增加了低丰度蛋白的鉴定深度；Spectronaut软件则为数据分析提供了强大的支持，不管是全面拥抱AI的directDIA检索，还是hybridDIA检索，将鉴定量推向新高度。这些优势共同提升了空间/单细胞蛋白质组研究的深度和广度，助力科学家深入解析空间/细胞异质性和生物学功能。
尖端质谱详细内容请查看链接： 精准质谱仪器推荐
以下列举两篇国际最新进展，采用上述最佳拍档方案，将单细胞蛋白鉴定量推向5000
1. Zilu Ye et al.& "High-throughput and scalable single cell proteomics identifies over 5000 proteins& per cell . "& bioRxiv 2023.11.27.568953
2. Julia A. Bubis et al.& "Challenging the Astral：mass analyzer - up to 5300 proteins per single-cell at unseen quantitative accuracy to study cellular heterogeneity . "& bioRxiv 2024.02.01.578358
空间蛋白组根据不同的研究目的，我们有4种方案：
