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空间或单细胞蛋白质组技术方案

在现代生物研究中,了: 空间异质 : 细胞异质 的蛋白质分布与表达对于揭示生物机制至关重要: 空间蛋白 技术通过高分辨率地描绘组织切片中蛋白质的空间分布,帮助我们理解蛋白质如何在组织微环境中变化。这种空间信息为疾病的早期诊断和治疗提供了新的视角: 与此同时 单细胞蛋白组…

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在现代生物研究中,了: 空间异质 : 细胞异质 的蛋白质分布与表达对于揭示生物机制至关重要: 空间蛋白 技术通过高分辨率地描绘组织切片中蛋白质的空间分布,帮助我们理解蛋白质如何在组织微环境中变化。这种空间信息为疾病的早期诊断和治疗提供了新的视角: 与此同时 单细胞蛋白组 技术允许我们在单个细胞层面深入分析蛋白质的表达和功能,从而揭示不同细胞类型及其状态之间的微小差异。这种技术为精准医学和个体化治疗开辟了新天地

目标 研究 组织微区域异质 : 细胞异质 的蛋白表达水平,为揭示生理病理表型、药物靶点的开发、及实现精准医疗都提供数据参考

材料 空间蛋白质组:提供冷冻或石蜡组织切片,也可以直接提供组织块 单细胞蛋白质组:提供分选好的单细胞,如果是组织样本,需要我们进行单细胞悬液制备和单细胞分选,请另询

平台 特色(空间和单细胞蛋白组

平台优势:我们搭建了完整的流程方案,从精准取样,到高效灵敏样品制备,到高通量质谱采集 数据分析

通过激光显微切割(LCM)获得组织切片微区域样本 ,或: 通过流式分选获得单细胞样本 ,在快速灵敏试剂盒的前处理下,实现蛋白提取、变性、酶解和纯化等步骤;再通过高灵敏的短梯度质谱进行数据采集,实现对低input样本进行蛋白深度检测;后续对这些数据我们有完整的分析设计方案,助您深度挖掘 空间 / 细胞 异质性的病理机制与biomarker识别

针对 激光显微切 或 单个细胞水平 的超微量样本,要求高灵敏、高通量的前处理,我们的样本制备方法具有如下优势

快速高灵敏 将微量与快速前处理方法结合,实现了单细胞尺寸样本快速蛋白前处理,总处理时间不:.5h

高通量 整合:6孔板中实现高通量样本前处理,可用于大规模样本分析

:”损耗: ABC三个步骤,从组织/细胞到上机肽段一管操作;

适用场景广: 适用: 临床医生易获得的组织切片样本 以及 流式分选的单细

尖端色谱质谱联合DIA技

目前最佳的高灵敏、高通量LC-MS方案就是IonOpticks Aurora 3系列色谱:+ timsTOF HT/Ultra和Astral质谱:+ DIA采集& + Spectronaut软件 IonOpticks Aurora 3系列色谱柱的高分离能力确保了复杂肽段的有效分离;timsTOF HT/Ultra和Astral质谱仪的低input和短梯度:/15min)满足了高通量的检测需求;DIA全息采集方式提供了更全面的数据,尤其是增加了低丰度蛋白的鉴定深度;Spectronaut软件则为数据分析提供了强大的支持,不管是全面拥抱AI的directDIA检索,还是hybridDIA检索,将鉴定量推向新高度 这些 势共同提升了 空间 / 单细 蛋白质组研究的深度和广度,助力科学家深入解析 空间 / 细胞 异质性和生物学功能

尖端质谱详细内容请查看链接: 精准质谱仪器推荐

以下列举两篇国际最新进展,采用上述最佳拍档方案,将单细胞蛋白鉴定量推:000

1. Zilu Ye et al.& "High-throughput and scalable single cell proteomics identifies over 5000 proteins& per cell . "& bioRxiv 2023.11.27.568953

2. Julia A. Bubis et al.& "Challenging the Astral:mass analyzer - up to 5300 proteins per single-cell at unseen quantitative accuracy to study cellular heterogeneity . "& bioRxiv 2024.02.01.578358

空间蛋白组根据不同的研究目的,我们有4种方案:

空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 1
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 1
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 2
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 2
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 3
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 3
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 4
空间或单细胞蛋白质组技术方案资料图 4