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CellenONE 高通量单细胞蛋白组检测

CellenONE高通量单细胞蛋白组检测方案

一站式高通量解决方案

CellenONE 自动化分选、IonOpticks 纳流色谱与 Orbitrap Astral / Astral Zoom 质谱联用。提供冻存细胞、冻存组织及血液分离细胞的接收评估、复苏解离、单细胞悬液制备、分选、检测和分析。

单细胞悬液制备、CellenONE 分选、前处理、纳流质谱与分析流程
单细胞悬液制备、CellenONE 分选、前处理、纳流质谱与分析流程

核心优势

  • 样本处理与转运:具有长途转运后复苏、解离、悬液制备与分选经验。
  • 质谱采集:14–16 min 短梯度方案兼顾通量与灵敏度;案例中的 10 min 方法单独标明。
  • 色谱分离:IonOpticks 纳流色谱用于低上样量肽段分离。
  • 蛋白覆盖:不同样本、细胞尺寸及采集条件下的实测结果分开报告,不作为统一检出承诺。

应用领域

  • 细胞图谱与异质性:免疫细胞、基质细胞、肿瘤细胞等分群。
  • 发育分化与命运:细胞分化、器官发育、胚胎发育与细胞重编程研究。
  • 疾病与微环境:肿瘤微环境、免疫反应、疾病模型和临床科研样本。
  • 药物响应:治疗前后比较、药物筛选、联合用药与罕见病机制研究。

生物信息学分析内容

  • 低质量细胞过滤、蛋白检出和整体表达质控。
  • PCA、UMAP、t-SNE 降维与细胞聚类。
  • 细胞簇特征蛋白筛选、GO 与通路富集。
  • 拟时序分析用于探索连续状态,不直接证明真实时间或细胞谱系。

交互分析示例可用于查看质控、分群及特征蛋白结果。

打开 SCP ANALYSIS

测试案例与实测数据

以下为 Astral Zoom、10 min 方法下的平均蛋白鉴定数,每组 n=3。3 个及 9 个细胞为合并检测,不属于单细胞鉴定数。

样本1 个细胞3 个细胞合并9 个细胞合并
斑马鱼细胞3,6365,0805,576
果蝇细胞2,3473,7894,085
HeLa 细胞5,7406,3196,443

另一组 14 min 梯度实验比较了新鲜、转运 8 天及转运 15 天样本,涉及肝、HeLa、脑和肾来源细胞,每组 n=10。转运案例不能外推为任意样本在 15 天内均能保持活性。

送样建议

样本建议
冻存细胞(推荐)3–6×10⁶ cells/mL,1 mL/管;干冰寄送,复苏活率 >75%;建议冻存 1 个月内使用。
冻存组织程序性冻存,约 200 mg;干冰寄送、避免反复冻融;由实验室评估解离条件。

至少提前 1 周沟通样本、冻存液、运输及分组设计;特殊组织先行评估。

组织解离与单细胞悬液制备流程
组织解离与单细胞悬液制备流程

咨询方案与送样