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蛋白-代谢联合分析

蛋白-代谢联合分析服务方案

蛋白-代谢联合分析服务方案

整合前沿质谱技术与多组学分析,全面解析生物学机制

为什么选择蛋白-代谢联合分析?

蛋白质组学与代谢组学是生物研究中相辅相成的两个关键组学领域。蛋白质,特别是酶类,调控着细胞代谢通路的运行,而代谢物则反映了细胞内最终的生物化学状态。

全面揭示生物机制

蛋白质调控代谢通路中的化学反应,代谢物则反馈影响蛋白功能,联合分析能够清晰展现上下游交互关系。

精准标志物发现

同时捕获蛋白与代谢物信息,提升生物标志物发现的特异性和敏感性。

探索因果机制

利用蛋白与代谢物之间的层级关系,结合统计和机器学习技术,深入解析疾病和药物作用机制。

易算服务的独特优势

自动化样本处理

  • 自研高通量自动化工作站,从蛋白提取到酶解、除盐实现全流程自动化

  • 微量和单细胞样本亦能稳定处理,最大程度减少样本损耗

前沿质谱平台

  • 蛋白质组:Bruker timsTOF HT和Thermo Orbitrap Astral高灵敏前沿质谱

  • 代谢组:SCIEX 7600/6600,Thermo Exploris 240高分辨质谱,实现代谢物的精准定量

专业数据分析

  • 蛋白与代谢物差异分析、通路分析、关联网络分析

  • 利用随机森林、XGBoost等机器学习算法构建预测模型

  • 提供专业的数据分析报告和发表级可视化图表

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适用样本类型与应用场景

样本类型

  • 组织样本:深入研究疾病机制或药物作用机制

  • 血浆/血清:用于生物标志物研究及疾病动态监测

  • 尿液样本:反映肾脏及系统性代谢排泄改变

应用场景

  • 疾病机制研究

  • 精准标志物筛选

  • 药物机制探索

  • 因果关系研究(孟德尔随机化分析)

成功案例

细菌耐药机制研究

复旦大学乔亮团队研究发现,细菌在抗生素刺激下,蛋白和代谢物共同提示关键通路的激活(如辅酶A合成通路)理解细菌耐药机制。

PNAS June 26, 2023 120 (27) e2301170120 · DOI: 10.1073/pnas.2301170120

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肝癌早期诊断标志物

通过蛋白-代谢联合分析,找到了一组比传统单一标志物AFP更灵敏、更特异的肝癌诊断组合分子,使肝癌早诊准确率明显提升。

VIEW, Volume: 5, Issue: 6 · DOI: 10.1002/VIW.20240031

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免疫治疗反应机制

明确肝细胞癌患者接受仑伐替尼联合抗PD-1治疗的疗效差异相关蛋白与代谢特征。

Cell Reports · DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113877

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服务流程

1

样本采集

同一批受试者提供样本

2

分组设计

疾病 VS 对照 / 不同亚型 / 不同阶段

3

AUTO前处理

自动化样本前处理

4

质谱采集

Flex/Astral (蛋白质组)
6600/7600 (代谢组)

5

数据分析

单组学分析 + 多组学整合

分析报告内容

统计鉴定、火山与聚类趋势分析
GO分析与可视化结果
通路富集与相关性分析
蛋白-代谢物关联网络分析
多组学Biomarker筛选
生存分析(临床样本)