TMT-DDA定量蛋白质组技术
同位素标记蛋白定量解决方案
TMT (Tandem Mass Tag)是一种体外同位素标记肽段的技术，能够标记不同样本的蛋白酶解肽段，将混合肽进行质谱数据依赖性采集（Data-dependent acquisition，DDA)检测，实现对生物样本中的全蛋白质组的定性定量分析，后续进一步比较不同样本中的表达差异。
完整解决方案
全流程方案与高深度检测结果
全流程方案
高效率、强分级、完善质控工作流程：
高效率：自动化3-4小时完成96例样本前处理
强分级：极微量（1-100μg）分级与全自动馏分收集
完善质控：3维QC模块-分级效果、标记效果、批次效应
兼容常见样本：组织/细胞/体液/菌体/10-100μg蛋白
数据检测能力
常规样本蛋白深度覆盖：
哺乳动物组织：高达10000个蛋白
哺乳动物细胞：高达10000个蛋白
血浆：＞1000个蛋白
磷酸化：高达40000个磷酸肽
标准化工作流程
精准操作确保高质量实验结果
样品准备
常见样本：组织/细胞/体液/菌体等
蛋白提取与酶解
高回收率蛋白提取与酶解策略
TMT标记与混合
低至5μg肽段，标记效率高达98%
极微量色谱分级
极微量分馏10或12个，全自动收集与合并
LC-MS/MS数据采集
混标肽一同上机，同位素标签在二级质谱中产生不同m/z的报告离子，以此获得同一肽段在不同样本中的表达差异
成功应用案例
顶尖期刊发表的TMT研究成果
颅内动脉瘤风险标志物发现研究
通过TMT蛋白质组和先前文献报道建立了颅内动脉瘤迄今最全的标志物库（717个候选蛋白），后续采用PRM靶向蛋白组联合机器学习策略构建了诊断panel，对颅内动脉瘤破裂和未破裂的分类达91.67%准确率。
研究对象
破裂_vs_未破裂_vs_对照的血清+组织
TMT发现队列：60例血清+10例组织
PRM验证队列：212+32例血清
结果：患病vs对照早期诊断panel(6个蛋白)
破裂vs未破裂风险分层panel(8个蛋白)
结肠癌无创诊断标志物研究
在尿液和组织样本中实施发现-验证-确认流程。TMT分析鉴定出581个诊断性蛋白和226个转移性蛋白，PRM验证筛选出3个诊断panel和4个转移风险panel，组织芯片验证了尿液标志物在组织中的表达变化。
研究对象
健康对照_vs_结肠癌无转移_vs_淋巴转移_vs_远端转移患者的尿液和组织
TMT发现队列：36例
PRM和免疫验证队列：82+312例
IHC组织确认队列：993例
TMT+PRM发现41个候选标志物
免疫验证5个尿液标志物
IHC组织确认3个标志物