Label-free DDA蛋白质组解决方案
Label-free蛋白组是对蛋白质酶解肽段直接进行LC-MS/MS分析的非标记技术，结合质谱数据依赖性采集(Data-dependent acquisition，DDA)模式分析样本中的蛋白组成(定性)和蛋白丰度(定量)。
该技术发展成熟，操作流程标准化，样本不受物种和样本类型限制，适用于解析非特异性酶切、糖基化修饰、未知修饰、未知序列等数据。
核心技术优势
技术成熟的非标记蛋白质组解决方案
技术成熟度高
标准化流程，前处理自动化操作，数据解析简单
样本兼容性强
组织、细胞、体液、胶条、IP等多种样本类型支持
应用领域广
蛋白组、多肽组、糖修饰组、IP-MS等全面适用
技术解决方案
四类专业应用方向的完整解决方案
蛋白质组分析
蛋白鉴定与定量解决方案
高通量自动化蛋白提取与酶解
高灵敏度质谱DDA扫描分析
专业数据解析、质控和生信分析
注：由于DIA数据覆盖度更深，目前蛋白组多采用DIA技术
送样要求
组织样本：10-20mg
细胞样本：≥1×10^6个细胞
菌体样本：≥50μL沉淀
BCA定量蛋白总量20-50μg
多肽组分析
内源性多肽谱全面解析
各种样本类型前处理技术
内源性多肽选择性分离（3kDa或10kDa）
质谱DDA扫描结合database序列比对和De Novo测序
多肽差异筛选，多肽所属蛋白功能富集
送样要求
组织样本：10-20mg
细胞样本：≥1×10^6个细胞
血清/血浆样本：≥100μL
多肽冻干粉：1mg
糖基化修饰分析
糖基化位点和糖链解析
完整糖肽高效富集技术
高覆盖糖基化位点鉴定
位点特异性糖链解析
高达1700条完整糖肽/样本鉴定能力
送样要求
蛋白总量：N糖肽≥300μg，O糖肽≥1mg
动物组织：≥30-50mg
植物组织：≥1g
细胞样本：1-2×107个细胞
IP-MS鉴定
互作蛋白高效鉴定技术
三种酶解方式全面兼容IP样本类型
高灵敏度质谱DDA扫描分析
整体质控FDR、score、质量精度、漏切
可设客户关注修饰，提供修饰鉴定
送样要求
beads沉淀（推荐）：≥1管
蛋白溶液：≥1管，提供buffer成分
胶条样本：1份，2×10mm或4×5mm
保存运输：-80℃保存，干冰运输，胶条可冰袋
成功应用案例
DDA蛋白组、多肽组、IP-MS相关研究成果
细胞外囊泡蛋白组研究
JCI Insight | 2024
研究人员使用label-free DDA蛋白质组学分析了支气管肺泡灌洗液中EVs(BALF-EVs)的蛋白质组成，比较了博来霉素处理小鼠和对照组的差异。
研究发现107种蛋白质在纤维化囊泡中富集，其中，SFRP1在EVs中显著富集。缺失Sfrp1显著抑制了成纤维细胞的促纤维化作用。
CoIP互作蛋白研究
Anal Bioanal Chem
研究开发了一种结合亚细胞分离与共免疫沉淀-质谱(CoIP-MS)的方法，以减少细胞组分的影响和假阳性结果。
成功识别并验证了C1QBP的新互作蛋白DLAT(丙酮酸脱氢酶（PDH）复合体组分)，揭示C1QBP表达水平影响PDH活性，提供了C1QBP在线粒体中调控能量代谢的新见解。
小鼠血清多肽组研究
Journal of Proteomics
研究者从弓形虫急性感染、慢性感染及对照小鼠收集血清样本进行多肽组分析，以研究感染过程中内源性多肽变化。
共识别607种内源性肽，其中急性感染与其他样本差异明显。GO分析感染与对照小鼠血清差异多肽，发现其所属蛋白与生物调节和结合活性相关，为新型诊断靶点提供参考。