临床大规模蛋白质组学检测
2018-12-20

临床蛋白质组学是将蛋白质组学技术应用于临床医学研究,是蛋白质组学的一个新的分支。在阐明疾病发生发展的机制,探索疾病预防、诊断、治疗的标志物和靶标以及人类重要疾病预防等方面具有重要意义。

临床蛋白质组学研究特点:

1.      蛋白质数量非常庞大

2.      对检测灵敏度的要求很高

3.      蛋白质含量范围差异大

4.      对蛋白质相互作用的检测是其重要内容

5.      临床样本的处理是其分析的瓶颈。


临床蛋白质组学研究流程:共包括三个层次,分别是临床蛋白质的发现,验证和深入研究。

一、临床样品蛋白质组的发现式检测

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二、候选蛋白质验证

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三、深入研究,比如细胞生物学验证及动物实验验证等。

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易算提供的临床蛋白质组学全套解决方案

非靶向发现——DIA/DDA非标记定量技术

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相关资料:PEAKSSpectronaut


靶向验证——PRM

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相关资料:SpectroDive



临床蛋白质组学在诊断标志物研究中的应用案例1

Discovery and Validation of Novel Protein Biomarkers in Ovarian Cancer Patient Urine. PROTEOMICS CLINICAL APPLICATIONS. 2018.

样本类型选择:

•        尿液样本

样本数目:

•        发现组群20例(10+10)

•        验证群组60例(10+10)

技术路线选择:

•        非靶向发现技术

•        验证技术选择——靶向验证PRM技术

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案例2

Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population. Mol Syst Biol. 2015 Feb; 11(2): 786.

在人双胞胎血浆中检测蛋白表达量差异,用以评估环境和遗传因素对血浆蛋白质组的影响。共检测了232个个体,定量342种血浆蛋白质。

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