SpectroMine
2018-12-12

革新鸟枪法蛋白质组学数据分析&超快、深度覆盖、高精度定量

近年来同位素标记定量技术日益更替和改进,使其在鸟枪法蛋白质组学定量分析中得到越来越广泛的应用。Biognosys作为数据非依赖采集技术(DIA)的共同发明人现如今也致力于将各类蛋白质组定量技术进行整合,开发了SpectroMine能够分析各类采集类型的质谱数据的软件,从定性、到DDA非标以及各类报告离子定量数据的分析。

主要功能:

1. DIA,DDA和PRM数据的搜库定性:支持对多种数据采集类型结果的同时分析。

2. 超快,支持超过1000个run的数据分析:创新的算法能够大大节约内存消耗,使得采用普通桌面电脑就能分析1000个以上的run,同时分析速度极快,一般5分钟左右即可分析完毕一个2小时的Fusion DDA数据,1小时即能分析完一整套ITRAQ定量数据。

3. 高可信度的统计方法:支持从肽段到蛋白水平的FDR质控。

4. 差异定量分析:基于非标记(LFQ)、报告离子标记(ITRAQ, TMT, EASI-TAG)的定量分析功能(DIA及PRM分析请使用Spectronaut和SpectroDive)。

5. 支持内嵌GO分析:内嵌GO分析及富集模块可以快速发现相关功能变化。

软件特性

133304_5101.png

SpectroMine采用了Biognosys独家开发的Pulsar搜索引擎,将搜库速度提升到了极致,同时支持DDA,DIA,PRM数据检索。SpectroMine具有启发式计算功能,将计算速度提升至极致。

在台式机CPU为i9-7960X平台上, 我们测试了50万张MS2谱图的ITRAQ数据,分析时间仅为1小时。

133326_1424.png

我们总是致力于获得尽可能多的蛋白质鉴定量。SpectroMine在实现Protein和Peptide两个层次同时FDR控制的情况下,能够实现高精确、高覆盖的定性数量。

133343_7997.png

SpectroMine的一个重要设计初衷便是充分支持同位素标记定量isobaric labeling quantification (ILQ),目前支持iTRAQ,TMT,EASI-TAG等标记定量方式。EASI-TAG定量是最新的大大降低常规iTRAQ/TMT定量压缩效应的替代方法,具有和真实差异极为接近的定量效果。即使在2个物种混合蛋白质组定量时,都能保证准确的定量结果。

支持的仪器

• Thermo Scientific Q Exactive Series

• Thermo Scientific Orbitrap Fusion Series

• SCIEX TripleTOF Series (5600, 5600+, 6600)

• Bruker Impact II

• Bruker timsTOF without ion mobility

• Waters Xevo G2-XS

如果您想了解更多关于Spectromine软件可联系我们:support@omicsolution.com或者参考技术手册:Spectromine软件手册。

上一篇: [上一篇] QUIC