技术流程
非变性提取蛋白
药物孵育组vs对照组平行实验（3vs3）
双酶切：限制性酶非特异性+胰酶特异性消化
平行设置仅胰酶酶切作为背景扣除
高分辨质谱定量分析有无药物组的差异肽段
送样要求
培养细胞：≥1×10⁷个细胞
动物组织：≥10mg
药物孵育方案需提前确认（浓度时间等）
不用裂解，干冰运输
药物靶点发现蛋白质组解决方案
基于LiP-MS与TPP技术的药靶发现平台
药靶发现是现代药物研发的核心挑战。我们的解决方案结合了两种前沿技术——基于蛋白质结构变化的LiP-MS（限制性酶切耦合质谱法）和基于热稳定性变化的TPP（热蛋白质组分析），无需构建化学探针或修改化合物结构，就能发现潜在药物靶点。
通过检测药物结合引起的蛋白结构变化（LiP-MS）和热稳定性变化（TPP），我们可以精准识别直接结合靶点、发现新的作用机制，并揭示药物的结合区域，大大加速药物研发进程。
无需探针构建
双技术互补验证
发现直接结合靶点
＞500种药物项目经验
核心技术优势
突破传统药物靶点发现技术的局限
免探针技术
无需构建化学探针，不改变药物结构，真实反映药物与靶点的相互作用
双技术互补
LiP-MS揭示结构变化区域，TPP检测热稳定性变化，双重验证提高准确性
高灵敏度检测
Orbitrap Eclipse/Exploris 480/Astral超高分辨率质谱系统，蛋白检测覆盖更深
技术解决方案
LiP-MS与TPP技术的完美结合
LiP-MS技术方案
基于蛋白质结构变化的药物靶点发现
3vs3
药物孵育vs对照
12例
双酶切和背景扣除两套数据
~4周
交付周期
LiP-MS技术流程
TPP技术方案
基于热稳定性变化的药物靶点发现
技术流程
非变性提取蛋白
药物孵育组vs对照组平行实验（如果需活细胞孵育，请客户孵育好寄送样品）
高温沉降，收集可溶性蛋白
胰酶消化
高分辨质谱定量分析有无药物组的差异蛋白
送样要求
培养细胞：≥1×10^7个细胞
动物组织：≥10mg
药物孵育方案需提前确认（浓度时间等）
不用裂解，干冰运输
3vs3
单温度点
2vs2×10
多温度点
~4周
交付周期
TPP技术流程
数据分析内容
全面深入的药靶发现分析方案
LiP-MS和TPP靶标筛选
药物孵育vs对照差异肽段/蛋白分析，GO功能注释与KEGG通路富集，根据差异变化与功能通路等信息筛选靶标
LiP-MS结合区域定位
结合LiP-Score、差异肽段变化区域与结构域注释，筛选潜在药物结合区域（LiP-MS特有）
拟合曲线(高阶方案特有)
结合TPP多温度热熔曲线和ΔTm值，或LiP-MS剂量-响应曲线细筛靶点
成功应用案例
LiP-MS和TPP药靶发现蛋白组创新应用
前列腺癌药物靶点发现
Thermal Proteome Profiling Strategy Identifies CNPY3 as a Cellular Target of Gambogic Acid for Inducing Prostate Cancer Pyroptosis
TPP策略发现藤黄酸直接靶向CNPY3蛋白，显著提升前列腺癌细胞焦亡效应
在人前列腺癌细胞中，通过TPP+SILAC技术识别到24种显著上调蛋白，其中锁定CNPY3为藤黄酸的关键靶点，该靶点与炎症体激活密切相关。随后通过SPR验证、分子对接分析和CETSA-WB等多重技术验证了药物靶点的可靠性。
TPP
技术方法
1038
定量蛋白
24
显著变化蛋白
慢性胰腺炎药物靶点发现
Corynoline protects chronic pancreatitis via binding to PSMA2 and alleviating pancreatic fbrosis
LiP-MS策略发现紫蓳灵（Cory）直接靶向PSMA2蛋白，减轻胰腺纤维化，保护慢性胰腺炎
在人胰腺星状细胞中，使用LiP-MS技术成功识别210种潜在药物结合蛋白，其中PSMA2在药物处理后全酶切肽段丰度增加，半酶切肽段丰度降低。通过分子对接、CETSA验证和敲低实验证实了Cdc42是药物作用的关键靶点。
LiP-MS
技术方法
210
潜在结合蛋白
PSMA2
进一步锁定