乳酸化修饰蛋白质组技术方案
蛋白质乳酸化修饰（Lactylation）是一种2018年首次发现的新型翻译后修饰类型。这一修饰过程是将乳酸转移至蛋白质中的赖氨酸（Lys，K）残基上，这种修饰同样是动态可逆的过程。乳酸化修饰与细胞代谢之间密切关联，目前乳酸化修饰机制研究已成为代谢与表观遗传交叉领域的前沿热点。
全流程解决方案
从样品处理到数据分析的完整流程
针对3-5mg蛋白样本富集乳酸化修饰肽段前处理方案。
样本类型：动植物组织/细胞/菌体等样本类型
样本前处理：提取总蛋白、蛋白酶解和乳酸化修饰肽富集
质谱检测：高通量高灵敏度质谱timsTOF或Astral分析
数据分析：鉴定和定量结果统计，蛋白功能分析和motif分析
送样建议
动物组织：100mg
植物组织：5g
微生物菌体：500μL
细胞：2×10^7
蛋白：3-5mg
实测数据
不同组织样本中的优异表现
物种：BALB/c小鼠
组织类型：脑、睾丸、肺、肾脏和肝脏
质谱：Orbitrap Astral
DIA采集模式，30min梯度
乳酸化修饰位点鉴定数
6000-10000个乳酸化位点
全面分析内容
多维数据揭示生物学意义
数据统计与质量控制
■ 乳酸化位点数量统计
■ 样本相关性分析和重复性评估
■ 质谱数据质量评估
■ 修饰位点置信度、定位及定量
差异分析
■ 乳酸化位点差异筛选
■ 差异热图与聚类分析
■ 乳酸化位点韦恩图分析
■ 乳酸化位点火山图
功能富集与网络分析
■ GO、KEGG通路富集分析
■ 蛋白-蛋白互作网络（PPI）
■ 通路注释可视化图
成功应用案例
乳酸化修饰蛋白组研究的调控研究
胃癌细胞中赖氨酸乳酸化（Kla）修饰蛋白质组学研究
研究设计
细胞模型：人胃癌AGS细胞系
乳酸处理：细胞暴露于20mM乳酸24小时，模拟瘤微环境高乳酸状态
对照组：等量生理盐水处理
实验：Kla肽段富集+质谱检测
主要发现
鉴定2375个Kla位点 (1014个蛋白)
剪接体功能通路显著富集
IHC发现胃癌组织Kla水平显著高于癌旁组织
胃肿瘤高水平Kla与不良预后相关
研究意义
首个哺乳动物全局Kla研究（填补非组蛋白Kla空白）
提出“乳酸-蛋白乳酸化-RNA剪接重编程”机制
发现乳酸化可能是胃癌的预后标志物