乙酰化修饰蛋白质组技术方案
蛋白质乙酰化修饰（Acetylation）是一种广泛存在于真核生物和原核生物中的翻译后修饰类型。这一修饰过程主要通过乙酰转移酶催化乙酰基转移至蛋白质中的赖氨酸（Lys，K）残基上，而去乙酰酶则负责去除乙酰基。由于乙酰化修饰是一个可逆的过程，它在调节细胞内各种生物功能、包括基因表达、细胞代谢和信号传导中具有非常重要的作用。
全流程解决方案
从样品处理到数据分析的完整流程
针对3-5mg蛋白样本富集乙酰化修饰肽段前处理方案。
样本类型：动植物组织/细胞/菌体等样本类型
样本前处理：提取总蛋白、蛋白酶解和乙酰化修饰肽富集
质谱检测：高通量高灵敏度质谱timsTOF或Astral分析
数据分析：鉴定和定量结果统计，蛋白功能分析和motif分析
送样建议
动物组织：100mg
植物组织：5g
微生物菌体：500μL
细胞：2×10^7
蛋白：3-5mg
实测数据
不同组织样本中的优异表现
物种：BALB/c小鼠
组织类型：脑、睾丸、肺、肾脏和肝脏
质谱：Orbitrap Astral
DIA采集模式，30min梯度
乙酰化修饰位点鉴定数
35000-46000个乙酰化位点
全面分析内容
多维数据揭示生物学意义
数据统计与质量控制
■ 乙酰化位点数量统计
■ 样本相关性分析和重复性评估
■ 质谱数据质量评估
■ 修饰位点置信度、定位及定量
差异分析
■ 乙酰化位点差异筛选
■ 差异热图与聚类分析
■ 乙酰化位点韦恩图分析
■ 乙酰化位点火山图
功能富集与网络分析
■ GO、KEGG通路富集分析
■ 蛋白-蛋白互作网络（PPI）
■ 通路注释可视化图
成功应用案例
乙酰化修饰蛋白组研究的调控研究
通过乙酰化组学结合功能验证揭示HDAC6介导的AKAP12去乙酰化是结肠癌转移的关键机制
研究设计
敲除HDAC6结肠癌细胞vs空载转导细胞
每组3个生物学重复
修饰肽段富集+乙酰化组学质谱检测
主要发现
筛选到18个显著变化乙酰化蛋白
AKAP12乙酰化水平在HDAC6敲除后上调2.2倍
CoIP验证HDAC6-AKAP12互作，后续检测HDAC6过表达上调AKAP12泛素化
研究意义
乙酰化组学发现HDAC6关键作用靶点AKAP12及其位点
患者中高表达的HDAC6通过对AKAP12去乙酰化及其泛素化降解，驱动结肠癌转移。
农学：乙酰化组学揭示内质网分子伴侣乙酰化在真菌孢子形成中有重要作用
研究设计
尖孢镰刀菌产孢vs非产孢菌丝
每组3个生物学重复
修饰肽段富集+乙酰化组学质谱检测
主要发现
鉴定1679个乙酰化位点（756个蛋白）
筛选111个乙酰化差异蛋白
内质网分子伴侣蛋白乙酰化显著下调
研究意义
乙酰化精确调控内质网分子伴侣活性
乙酰化动态平衡协调蛋白折叠与发育
乙酰化调控直接控制丝状真菌形态建成的机制