琥珀酰化修饰蛋白质组技术方案
蛋白质琥珀酰化修饰（Succinylation）是翻译后修饰的一种，指琥珀酰辅酶A（succinyl-CoA）将琥珀酰基团共价结合到赖氨酸残基上的过程。这种修饰可能影响蛋白质的结构、功能和相互作用。琥珀酰化与乙酰化具有显著的相关性，许多发生琥珀酰化的位点同时也能检测到乙酰化修饰。琥珀酰化广泛参与核心能量代谢途径，如三羧酸循环和糖代谢，与线粒体代谢密切相关。
全流程解决方案
从样品处理到数据分析的完整流程
针对3-5mg蛋白富集琥珀酰化修饰肽段前处理方案。
样本类型：动植物组织/细胞/菌体等样本类型
样本前处理：提取总蛋白、蛋白酶解和琥珀酰化修饰肽富集
质谱检测：高通量高灵敏度质谱timsTOF或Astral分析
数据分析：鉴定和定量结果统计，蛋白功能分析和motif分析
送样建议
动物组织：100mg
植物组织：5g
微生物菌体：500μL
细胞：2×10^7
蛋白：3-5mg
实测数据
不同组织样本中的优异表现
物种：BALB/c小鼠
组织类型：脑、睾丸、肺、肾脏和肝脏
质谱：Orbitrap Astral
DIA采集模式，30min梯度
琥珀酰化修饰位点鉴定数
13000-25000个琥珀酰化位点
全面分析内容
多维数据揭示生物学意义
数据统计与质量控制
■ 琥珀酰化位点数量统计
■ 样本相关性分析和重复性评估
■ 质谱数据质量评估
■ 修饰位点置信度、定位及定量
差异分析
■ 琥珀酰化位点差异筛选
■ 差异热图与聚类分析
■ 琥珀酰化位点韦恩图分析
■ 琥珀酰化位点火山图
功能富集与网络分析
■ GO、KEGG通路富集分析
■ 蛋白-蛋白互作网络（PPI）
■ 通路注释可视化图
成功应用案例
琥珀酰化修饰蛋白组研究的调控研究
通过琥珀酰化组学揭示OXCT1作为新型琥珀酰基转移酶调控肝癌进程
研究设计
HepG2 肝癌细胞，3重复
过表达OXCT1_vs_空载体转染
修饰组：抗体富集+质谱检测
验证：IP+体外激酶实验
主要发现
鉴定到2632个位点，70个位点在OXCT1 OE 组显著上调
LACTB K284 是差异最显著的位点
点突变和酶活性验证OXCT1琥珀酰转移酶功能(G424位点)
研究意义
首次揭示 OXCT1 的非经典功能（琥珀酰转移酶），突破其传统代谢酶认知
LACTB K284 琥珀酰化水平可作为肝癌分期和预后的生物标志物
抑制 OXCT1 -G424活性可能成为新靶点