蛋白质组学检测所用质谱通常具有极高的灵敏度,进行检测时所需上样多肽量一般都是0.1~1μg左右,算上进样瓶损耗,似乎相关实验只要准备个几μg多肽就可以了吧?那为何我们在准备样品的时候发现动不动就需要准备个几g,几百mg的样品呢?
|
易算针对以上这些问题推出了一系列针对性解决方案:
1. PreOmics iST试剂盒,极大程度提升蛋白质提取效率并简化了操作步骤;
2. EasyPept Label易肽标记定量试剂盒,实现10μg级别的多肽TMT标记;
3. EasyPept易肽PTMp磷酸化富集试剂盒,实现100μg级别多肽起始磷酸化富集;
有分级需求的你看到这里可能会心想:天底下有这等好事,可偏偏就是与我无缘,该准备大量的样品还是得准备,该用的试剂也还是得用,该等的时间也还是要等(如果你有过等抽干样品等到半夜的经历...相信你会和我感同身受...)
Q
怎样才能用最少的样品
省时省力地完成馏分收集呢?
A
易算针对最适合微量体系分离的nanoLC系统设计了全自动微量馏分收集系统:EasyPept Frac 易肽自动微量馏分收集系统,真正实现了几μg到几十μg多肽的任意分级操作!
易肽Frac系统构成及分析流程
易肽Frac系统分离效果
10ug Hela肽段测试12个Frac建库共得到precursors 141,177条,peptides 104,240条,protein groups 9117个。每个Frac平均可鉴定到precursors 20,468条,peptides 16,613条,protein groups 5369个。
图5 Hela细胞分级TIC展示
12ug去高丰度血清测试24个Frac建库共得到precursors 72,279条,peptides 56,734条,protein groups 5805个。每个Frac平均可鉴定到precursors 13,528条,peptides 11,204条,protein groups 3137个。
图6 血清分级建库数据展示
图7 血清分级建库TIC展示
我司客户采用该套系统针对不同含量(10ug/20ug)的鼠肝TMT标记多肽进行分馏分,并与常规液相分级(200ug)结果进行横向对比。可以明显看出,就算是起始量是十分之一的情况下,仍能获得可观的鉴定数量。
未来,我们将会在这套系统上继续测试DIA分级建库,磷酸化TMT分级定量以及N糖肽TMT分级定量等等等等。若您对我司EasyPept Frac全自动馏分收集系统感兴趣的话,请联系我们哦!